Graduação - CBRAG
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Navegando Graduação - CBRAG por CNPq "CNPQ::CIENCIAS BIOLOGICAS::GENETICA::GENETICA ANIMAL"
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Trabalho de Curso - Graduação - Monografia Acesso aberto (Open Access) Análise comparativa e filogenética de mitogenomas de garoupas do atlântico (Perciformes; Epinephelidae)(2025-02-20) REIS, Glória Maria da Costa; SOUSA, Rodrigo Petry Corrêa de; http://lattes.cnpq.br/0921857281639788; https://orcid.org/0000-0002-3626-4484; SOUZA, Marcelo Nazareno Vallinoto de; http://lattes.cnpq.br/9327173329561099Os peixes da família Epinephelidae, comumente conhecidos como garoupas, são espécies de grande importância ecológica e econômica, sendo relevantes tanto para a conservação marinha quanto para a pesca comercial. O estudo dos mitogenomas dessas espécies é essencial para entender a diversidade genética do grupo, assim como, evolução e adaptação destes aos diferentes ambientes marinhos. Nesse contexto, este estudo focou na análise dos mitogenomas das espécies Epinephelus morio (garoupa-vermelha) e Mycteroperca interstitialis (garoupa-deboca-amarela) da família Epinephelidae. Os mitogenomas sequenciados apresentaram comprimentos de 16.418pb e 17.455pb, respectivamente, e continham 37 genes mitocondriais, incluindo 13 genes codificadores de proteínas (PCGs), 22 tRNAs e 2 rRNAs, além de uma região de controle. A organização e a ordem gênica observadas são consistentes com o padrão encontrado em outras espécies da família e na maioria dos peixes teleósteos. Ambos os mitogenomas apresentaram uma composição de nucleotídeos semelhante, com variações pequenas nas proporções nucleotídicas. A análise do uso de códons e a estrutura dos genes mostraram semelhanças com outras espécies da família. A árvore filogenética gerada com base nos 13 genes codificadores de proteínas revelou relações próximas entre E. morio e outras espécies da mesma família, contudo, observam-se algumas incongruências nas relações entre gêneros, em virtude de arranjos com padrões parafiléticos de alguns grupos. Este estudo oferece uma base sólida em análises filogenéticas e destaca a importância de integrar dados moleculares para entender melhor as relações evolutivas entre as garoupas.Trabalho de Curso - Graduação - Monografia Acesso aberto (Open Access) Dinâmica de especiação e expansão populacional em Ucides: insights a partir da análise genética de Ucides occidentalis (Ortmann, 1897) e Ucides cordatus (Linnaeus, 1763) (Decapoda, Brachyura)(2023-12-13) NUNES, André Lucas Alves; SILVA, Adam Rick Bessa da; http://lattes.cnpq.br/6415904655659166; https://orcid.org/0000-0002-6093-6180O gênero Ucides, composto pelas espécies Ucides occidentalis e Ucides cordatus, é distribuído amplamente pelas costas do Atlântico e Pacífico na América Central e do Sul. Essas espécies são fundamentais para estudar a evolução e distribuição histórica de organismos costeiros. Sua distribuição geográfica indica um evento de vicariância, possivelmente devido a alterações geológicas e climáticas, que teriam separado uma população ancestral e levado à especiação. Este estudo analisou 116 sequências genéticas (46 de U. occidentalis e 70 de U. cordatus), usando o gene COI para confirmar o status taxonômico das subespécies de Ucides. A divergência genética entre as linhagens variou de 0.152 a 0.192% na distância p-distance, com uma estimativa de divergência temporal de cerca de 2.7 milhões de anos. Não foram encontradas subestruturas significativas dentro de cada grupo, indicando populações panmíticas para ambas espécies. Análises de BSP mostraram um crescimento populacional que começou há cerca de 15 mil anos, para ambas as espécies. A expansão demográfica recente está relacionada ao fim do Último Máximo Glacial e à expansão dos manguezais, o que destaca a importância destes resultados para entender a evolução, dinâmica populacional e conservação destas espécies.Trabalho de Curso - Graduação - Relatório Acesso aberto (Open Access) Estudo filogeográfico de Odontophorus capueira (aves: odontophoridae), com ênfase na comparação das populações disjuntas do nordeste/sudeste (Parte II)(2023-12-05) MARIANO, Hévila de Carvalho; REGO, Pericles Sena do; http://lattes.cnpq.br/2700468443907633; https://orcid.org/0000-0002-4537-946XA espécie Odontophorus capueira, conhecida popularmente por uru-capoeira, uru-do-nordeste ou perdiz-uru, é um pequeno galináceo florestal topetudo, pertencente à família Odontophoridae. O estudo objetiva compreender o padrão filogeográfico para a espécie Odontophorus capueira, avaliando por meio de marcadores moleculares (sequencias mitocondriais e nucleares), se as subespécies correspondem à populações estruturadas e apresentam indicativos que validem sua elevação de nível taxonômico à espécie plena. Tais informações poderão ser utilizadas em futuros planos de conservação, principalmente para população do nordeste brasileiro.Trabalho de Curso - Graduação - Artigo Acesso aberto (Open Access) Inferências moleculares sugerem diversidade críptica de Sylvilagus brasiliensis (Logomorpha: Leporidae) nas Américas Central e Sul(2023-12-13) OLIVEIRA, Juliana Ribeiro de; SILVA, Adam Rick Bessa da; http://lattes.cnpq.br/6415904655659166Sylvilagus brasiliensis, conhecido como Tapiti, destaca-se pela sua ampla distribuição geográfica nas Américas. Este animal é encontrado em vários biomas do Brasil, gerando debates taxonômicos acerca da possível existência de espécies crípticas e do impacto de fatores ambientais na sua diferenciação. Nossas análises focaram no gene 12S rRNA e identificaram dois clados distintos dentro de S. brasiliensis: Clado América Central e Clado América do Sul, sem fluxo gênico entre eles. A rede de haplotipos e a significativa divergência genética (1,6% para Da e 2% para p-distance) encontrada corroboram a existência de dois haplogrupos distintos ao longo da distribuição da espécie. A descontinuidade genética apresenta uma aparente relação com os Andes como barreira, atuando como um evento vicariante para esta espécie. A função dos Andes como barreira geográfica na diversificação de espécies é particularmente importante, uma vez que as populações ancestrais de S. brasiliensis provavelmente se originaram na América Central, dispersando-se posteriormente para o sul e sendo separadas pelos Andes. Os resultados mostram forte impacto taxonômico para esta espécie, embora mais pesquisas, especialmente com amostragens mais abrangentes, sejam necessárias para compreender a diversificação e conservação do S. brasiliensis, uma espécie em risco de extinção.Trabalho de Curso - Graduação - Monografia Acesso aberto (Open Access) Marcadores mitocondriais para identificação da diversidade de Anostomidae(2025-03-31) NASCIMENTO, Bruna Gabriele Cardoso; VENEZA, Ivana Barbosa; http://lattes.cnpq.br/4570488200672692; https://orcid.org/0000-0002-3528-1290; GOMES, Grazielle Fernanda Evangelista; http://lattes.cnpq.br/5740656339448561; https://orcid.org/0000-0001-8898-0311A família Anostomidae, composta por peixes de água doce neotropicais, destaca-se pela sua diversidade e importância ecológica e econômica nas áreas onde ocorrem. No entanto, trata-se de um grupo controverso quanto à real diversidade registrada, relações filogenéticas complexas e identificação de espécies problemática. Diante disso, este estudo teve como objetivo investigar a eficiência de fragmentos mitocondriais para determinação de espécies de Anostomidae. Para isso, a pesquisa foi conduzida em dez localidades, onde foram amostrados 127 indivíduos, a partir dos quais foram amplificados fragmentos mitocondriais do gene Citocromo Oxidase C, Subunidade I (COI) e Região Controle (RC). Representantes de haplótipos de ambas as regiões genéticas estudadas foram confrontadas em bancos públicos de sequências, além da aplicação da identificação filogenética, baseada na topologia de cladogramas, auxiliada por identificação morfológica. Os resultados demonstraram que o gene COI apresentou limitações na distinção de espécies a partir das comparações em bancos públicos de sequências, o que foi indicado pela alta similaridade genética entre múltiplas espécies, algo corroborado pela Inferência Bayesiana desse fragmento, onde os clados não demonstraram arranjos indistintos a nível de espécie e gênero. Por outro lado, a análise filogenética baseada na RC revelou uma melhor resolução para a discriminação dos gêneros Leporinus, Megaleporinus e Schizodon, assim como para espécies, em conformidade com a identificação morfológica. No entanto, a escassez de sequências da RC em bancos públicos limitou sua aplicabilidade para identificação molecular de Anostomidae. Assim, o uso desse fragmento mitocondrial mostra-se promissor como alternativa, aliado à morfologia, para aprimorar a identificação e delimitação de anostomídeos, e dessa forma, pode contribuir com estudos taxonômicos e filogenéticos do grupo.Trabalho de Curso - Graduação - Monografia Acesso aberto (Open Access) Posicionamento taxonômico da população de Pyrrhura sp. residente no município de Conde (BA) através de análise molecular(2022-07-06) SANTOS, Giselle Silva dos; RÊGO, Péricles Sena do; http://lattes.cnpq.br/2700468443907633Trabalho de Curso - Graduação - Artigo Acesso aberto (Open Access) Using copepods to develop a didactic strategy for teaching species concepts in the classroom(2022-07-06) ROSARIO, Renata Furtado do; SOUZA, Marcelo Nazareno Vallinoto de; http://lattes.cnpq.br/9327173329561099Trabalho de Curso - Graduação - Monografia Acesso aberto (Open Access) Validação de protocolo, baseado em PCR multiplex, para identificação de filés de bagres do gênero Brachyplatystoma(2023-11-27) SILVA, Ana Claudia Carvalho da; SILVA, Simoni Santos da; http://lattes.cnpq.br/0818422393872186No Brasil, os peixes Brachyplatystoma filamentosum - filhote, Brachyplatystoma rousseauxi – dourada e Brachyplatystoma vaillantii – piramutaba, são importantes recursos pesqueiros, cujos filés vêm sendo substituídos por peixes de menor valor econômico, caracterizando fraude comercial. Portanto, foi desenvolvido protocolo, baseado em PCR multiplex do COI mitocondrial, para identificar as espécies pelo padrão de bandeamento e avaliar a autenticidade dos produtos processados. Desta forma, o presente trabalho objetivou validar o protocolo multiplex desenvolvido para identificação e autenticação destes peixes processados. Foram coletadas 128 amostras de peixes rotulados como filhote (N = 6, 4 postas e 2 filés), dourada (N = 62, 21 postas e 41 filés) e piramutaba (N = 60, 5 postas e 55 filés). O DNA foi extraído e o protocolo multiplex utilizado, resultando em 85,94% dos produtos contendo a banda controle (~650 pb) e o fragmento espécie-específico de ~254 pb para a dourada, ~405 pb para a piramutaba e -466 pb para o filhote. Por outro lado, 14,06% (N = 18) das amostras não correspondiam à espécie descrita no rótulo, e a substituição foi observada apenas na dourada a qual foi trocada por piramutaba (N = 15) e Sciades proops (N = 3). A dourada possui maior valor agregado que a piramutaba e S. proops, portanto, sugerimos que as substituições são fraudulentas, visando o lucro das empresas em detrimento do consumidor. Diante destes resultados, conclui-se que a PCR multiplex é um protocolo eficiente, rápido, sensível e econômico, que pode ser utilizada para a autenticação de produtos processados.