Navegando por Orientador "SOUZA, Marcelo Nazareno Vallinoto de"
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Trabalho de Curso - Graduação - Monografia Acesso aberto (Open Access) Análise comparativa e filogenética de mitogenomas de garoupas do atlântico (Perciformes; Epinephelidae)(2025-02-20) REIS, Glória Maria da Costa; SOUSA, Rodrigo Petry Corrêa de; http://lattes.cnpq.br/0921857281639788; https://orcid.org/0000-0002-3626-4484; SOUZA, Marcelo Nazareno Vallinoto de; http://lattes.cnpq.br/9327173329561099Os peixes da família Epinephelidae, comumente conhecidos como garoupas, são espécies de grande importância ecológica e econômica, sendo relevantes tanto para a conservação marinha quanto para a pesca comercial. O estudo dos mitogenomas dessas espécies é essencial para entender a diversidade genética do grupo, assim como, evolução e adaptação destes aos diferentes ambientes marinhos. Nesse contexto, este estudo focou na análise dos mitogenomas das espécies Epinephelus morio (garoupa-vermelha) e Mycteroperca interstitialis (garoupa-deboca-amarela) da família Epinephelidae. Os mitogenomas sequenciados apresentaram comprimentos de 16.418pb e 17.455pb, respectivamente, e continham 37 genes mitocondriais, incluindo 13 genes codificadores de proteínas (PCGs), 22 tRNAs e 2 rRNAs, além de uma região de controle. A organização e a ordem gênica observadas são consistentes com o padrão encontrado em outras espécies da família e na maioria dos peixes teleósteos. Ambos os mitogenomas apresentaram uma composição de nucleotídeos semelhante, com variações pequenas nas proporções nucleotídicas. A análise do uso de códons e a estrutura dos genes mostraram semelhanças com outras espécies da família. A árvore filogenética gerada com base nos 13 genes codificadores de proteínas revelou relações próximas entre E. morio e outras espécies da mesma família, contudo, observam-se algumas incongruências nas relações entre gêneros, em virtude de arranjos com padrões parafiléticos de alguns grupos. Este estudo oferece uma base sólida em análises filogenéticas e destaca a importância de integrar dados moleculares para entender melhor as relações evolutivas entre as garoupas.Trabalho de Curso - Graduação - Monografia Acesso aberto (Open Access) Caracterização comparativa dos genomas mitocondriais de Anableps anableps (LINNAEUS, 1958) e Anableps microlepis (Müller e Troschel, 1844) (Cyprinodontiformes: Anablepidae)(2026-07-20) ROSÁRIO, Murilo Furtado do; SOUSA, Rodrigo Petry Corrêa de; BRITO, Carla Denise Bessa de; http://lattes.cnpq.br/0921857281639788; http://lattes.cnpq.br/3118860174342134; https://orcid.org/0000-0002-3626-4484; https://orcid.org/0000-0002-8469-0138; SOUZA, Marcelo Nazareno Vallinoto de; http://lattes.cnpq.br/9327173329561099Nas últimas décadas, o desenvolvimento das tecnologias de Sequenciamento de Nova Geração (NGS), aliado ao avanço de ferramentas bioinformáticas para montagem, anotação e validação de genomas, ampliou significativamente a obtenção de mitogenomas completos, possibilitando análises comparativas da organização gênica, composição nucleotídica, uso de códons, rearranjos e relações filogenéticas em peixes. Apesar desse avanço, a disponibilidade de genomas mitocondriais completos ainda permanece desigual entre os representantes de Teleostei. Na ordem Cyprinodontiformes, embora algumas famílias estejam relativamente bem representadas, outras ainda apresentam escassez de informações mitogenômicas, limitando estudos comparativos e inferências sobre sua história evolutiva. Entre elas destaca-se a família Anablepidae, cujos representantes apresentam adaptações morfológicas e ecológicas singulares, mas permanecem pouco estudados sob a perspectiva genômica. As espécies Anableps anableps e Anableps microlepis, popularmente conhecidas como tralhotos ou peixesde-quatro-olhos, apresentam uma adaptação ocular única, caracterizada pela divisão horizontal da córnea e da retina, que permite visão simultânea acima e abaixo da superfície da água. Essas espécies habitam ambientes estuarinos e costeiros da costa norte da América do Sul, desempenham importante papel ecológico nas cadeias tróficas e apresentam potencial como bioindicadoras de alterações ambientais. Entretanto, até o momento, inexistiam descrições de seus genomas mitocondriais completos. Diante dessa lacuna, este trabalho propõe a caracterização dos mitogenomas completos de A. anableps e A. microlepis. Para isso, os genomas foram montados, anotados e caracterizados quanto à sua organização estrutural, composição nucleotídica e conteúdo gênico, sendo comparados com outros representantes de Cyprinodontiformes para investigar suas relações evolutivas. Os resultados ampliam a representatividade da família Anablepidae em bancos de dados públicos e fornecem uma base para futuros estudos em filogenia, filogeografia, genética da conservação e evolução dos genomas mitocondriais de peixes estuarinos.Trabalho de Curso - Graduação - Monografia Acesso aberto (Open Access) DNA Barcoding revela diversidade molecular na espécie Eleotris melanosoma Bleeker, 1853 (Eleotridae: gobiiformes)(2026-07-16) GORDO, Vinícius Cunha; COSTA, Aurycéia Jaquelyne Guimarães da; http://lattes.cnpq.br/5342395629825218; SOUZA, Marcelo Nazareno Vallinoto de; http://lattes.cnpq.br/9327173329561099A família Eleotridae compreende peixes anfídromos conhecidos como "sleepers", cuja identificação taxonômica é historicamente complexa devido ao extremo conservadorismo morfológico e à ocorrência de espécies crípticas. O objetivo deste estudo foi diagnosticar o status taxonômico de diferentes populações de Eleotris melanosoma por meio de DNA Barcoding e da delimitação automatizada de espécies. Sequências do gene mitocondrial Citocromo C Oxidase Subunidade I (COI), totalizando um alinhamento de 573 pares de bases (pb) e abrangendo 14 espécies do gênero Eleotris, foram obtidas de bancos de dados públicos e analisadas por meio do método de agrupamento de Neighbor-Joining (K2P) e do algoritmo Automatic Barcode Gap Discovery (ABGD). A análise de distribuição de distâncias genéticas revelou um padrão bimodal marcante, evidenciando um hiato de código de barras (barcode gap) bem definido que estabeleceu um consenso estável de 20 Unidades Taxonômicas Operacionais Moleculares (MOTUs) para o gênero. A topologia filogenética demonstrou que E. melanosoma não compõe um clado homogêneo, dividindo-se em três linhagens geneticamente divergentes e geograficamente estruturadas: a Linhagem 1, correspondente a espécimes da Indonésia e Palau (divergência intraespecífica de 0,43%); a Linhagem 2, que abrange indivíduos da Polinésia Francesa e Ilhas Salomão, apresentando a maior divergência interna (1,3%); e a Linhagem 3, vinculada ao complexo Eleotris diamsoi na região de Madagascar, Mayotte e África do Sul (0,15%). A divergência genética interespecífica par a par (distância p) dentro do complexo atingiu 5,4% entre as Linhagens 1 e 2, e até 7,3% em relação à Linhagem 3, confirmando a existência de espécies crípticas sob o morfotipo clássico de E. melanosoma. Adicionalmente, as análises recuperaram clusters estruturados para Eleotris fusca e mantiveram as sequências de Eleotris perniger agregadas em uma única MOTU, embora sob uma divergência intraespecífica relativamente alta de 1,3%, sugerindo um processo de diferenciação geográfica incipiente ou fluxo gênico residual. Os resultados confirmam a robustez do gene COI combinado ao algoritmo ABGD como ferramentas moleculares fundamentais para refinar hipóteses evolutivas e guiar uma abordagem taxonômica integrativa na família Eleotridae.Trabalho de Curso - Graduação - Artigo Acesso aberto (Open Access) Using copepods to develop a didactic strategy for teaching species concepts in the classroom(2022-07-06) ROSARIO, Renata Furtado do; SOUZA, Marcelo Nazareno Vallinoto de; http://lattes.cnpq.br/9327173329561099