Avaliação de variantes genéticas e o risco de câncer oral: achados de revisão sistemática com abordagem bayesiana

Introdução: As neoplasias orais abrangem diversos tumores na cavidade oral, sendo o carcinoma de células escamosas o mais comum, representando 90% dos casos. O câncer oral teve 389.846 novos casos e 188.438 óbitos em 2022, com previsão de aumento anual de 2% até 2030. Fatores de risco incluem tabagismo, álcool e infecções pelo HPV. Estudos também associam variações genéticas e mediadores imunológicos ao risco da doença, com metanálises ajudando a entender o papel dessas variantes genéticas no câncer oral. Objetivo: este estudo teve como objetivo avaliar o nível de taxas de falso-positivos por meio de uma abordagem bayesiana em dados meta-analíticos sobre variações genéticas em genes mediadores imunológicos relacionados ao risco de câncer oral. Materiais e métodos: foi realizada uma busca sistemática por meta-análises nesta área, publicadas antes de 2 de abril de 2024, em várias bases de dados médicas. Os cálculos para a Probabilidade de Taxa de Falso-Positivo (FPRP) e a Probabilidade Bayesiana de Descoberta Falsa (BFDP) foram realizados para avaliar a relevância com um poder estatístico de 1,2 e 1,5 de Razão de Chances (OR) em uma probabilidade prévia de 10-3 e 10-6. Além disso, uma avaliação metodológica foi realizada por meio dos Critérios de Veneza, e redes gene-gene e proteína-proteína foram desenhadas como análises in silico. Resultados: dez meta-análises envolvendo os genes/polimorfismos TNFA/rs361625/rs1800629, VEGF/rs3025039, IL4/rs2070874, IL6/rs1800795, IL8/rs4073 e IL10/rs1800896 foram incluídas. 88 valores de associação OR significativos das meta-análises permitiram a realização de 336 cálculos para FPRP e 176 para BFDP. Encontramos 35 valores relevantes (10,42%) para FPRP e 59 valores relevantes (33,52%) para BFDP, demonstrando que as variantes em VEGF e IL10 têm associação significativa com o câncer oral. As redes gene-gene e proteína-proteína evidenciaram o papel dos genes VEGF, TNFA, IL4, IL6, IL8 e IL10 na fisiopatologia da doença. Conclusão: os cálculos bayesianos e as análises in silico indicaram os polimorfismos rs3025039 e rs1800896 nos genes VEGF e IL10, respectivamente, como biomarcadores moleculares relevantes para a avaliação do risco de câncer oral.