Navegando por Assunto "Phylogeny"
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Trabalho de Curso - Graduação - Monografia Acesso aberto (Open Access) Análise comparativa e filogenética de mitogenomas de garoupas do atlântico (Perciformes; Epinephelidae)(2025-02-20) REIS, Glória Maria da Costa; SOUSA, Rodrigo Petry Corrêa de; http://lattes.cnpq.br/0921857281639788; https://orcid.org/0000-0002-3626-4484; SOUZA, Marcelo Nazareno Vallinoto de; http://lattes.cnpq.br/9327173329561099Os peixes da família Epinephelidae, comumente conhecidos como garoupas, são espécies de grande importância ecológica e econômica, sendo relevantes tanto para a conservação marinha quanto para a pesca comercial. O estudo dos mitogenomas dessas espécies é essencial para entender a diversidade genética do grupo, assim como, evolução e adaptação destes aos diferentes ambientes marinhos. Nesse contexto, este estudo focou na análise dos mitogenomas das espécies Epinephelus morio (garoupa-vermelha) e Mycteroperca interstitialis (garoupa-deboca-amarela) da família Epinephelidae. Os mitogenomas sequenciados apresentaram comprimentos de 16.418pb e 17.455pb, respectivamente, e continham 37 genes mitocondriais, incluindo 13 genes codificadores de proteínas (PCGs), 22 tRNAs e 2 rRNAs, além de uma região de controle. A organização e a ordem gênica observadas são consistentes com o padrão encontrado em outras espécies da família e na maioria dos peixes teleósteos. Ambos os mitogenomas apresentaram uma composição de nucleotídeos semelhante, com variações pequenas nas proporções nucleotídicas. A análise do uso de códons e a estrutura dos genes mostraram semelhanças com outras espécies da família. A árvore filogenética gerada com base nos 13 genes codificadores de proteínas revelou relações próximas entre E. morio e outras espécies da mesma família, contudo, observam-se algumas incongruências nas relações entre gêneros, em virtude de arranjos com padrões parafiléticos de alguns grupos. Este estudo oferece uma base sólida em análises filogenéticas e destaca a importância de integrar dados moleculares para entender melhor as relações evolutivas entre as garoupas.Trabalho de Curso - Graduação - Monografia Acesso aberto (Open Access) Identificação molecular das espécies de baiacu do gênero Colomesus Gill, 1884 na região de Breves, Ilha de Marajó(2020-07-21) ANDRADE, Valéria Martins de; FREITAS, Tiago Magalhães da Silva; http://lattes.cnpq.br/5148299236654901; https://orcid.org/0000-0003-3203-3408; SALES, João Bráullio de Luna; http://lattes.cnpq.br/1304788054324708; https://orcid.org/0000-0001-5914-2124A ordem Tetraodontiforme está distribuída em mares e águas doces de clima tropical e temperado. Possuem notável diversidade em forma, tamanho e estilo de vida. Esta ordem abriga peixes popularmente conhecidos como “baiacus” pertencentes as famílias, Diodontidae e Tetraodontidae. Baiacus possuem poucas características externas úteis para taxonomia e estas são facilmente distorcidas quando os espécimes são fixados em formol e preservadas em etanol, tornando difícil o processo de reconhecimento de espécies e sua classificação. Dessa forma, ferramentas complementares à sistemática, como a utilização de DNA, vêm auxiliando pesquisadores na investigação da presença de novas linhagens moleculares. DNA Barcoding, é um método para a identificação rápida de espécies, baseado na extração de uma sequência de DNA de uma pequena amostra de um organismo utilizando o gene COI como marcador universal. O objetivo do presente estudo é, através da ferramenta do DNA Barcoding, investigar qual linhagem do gênero Colomesus, ocorre na região de Breves, Ilha do Marajó. Amostras de tecido muscular foram retiradas de oito espécimes previamente identificadas como Colomesus asellus coletados na região de Breves onde as sequências geradas foram comparadas com sequências disponíveis de outras localidades. Os resultados revelaram a formação de três clados distintos com valor de suporte significativos sugerindo a existência de uma nova linhagem dentro do gênero. Foi possível demonstrar desta forma, a eficácia da ferramenta DNA Barcode em evidenciar que o status da espécie em questão na região de Breves deve ser revisado com ampliações de amostragens ao longo da região oeste da Ilha do Marajó.Trabalho de Curso - Graduação - Monografia Acesso aberto (Open Access) Relações filogenéticas do gênero Rhinoptera Van Hasselt, 1824 com ênfase nas espécies do Atlântico Sul Ocidental(2022-07-13) CUNHA, Yasmim Trindade Carneiro da; SALES, João Braullio de Luna; http://lattes.cnpq.br/1304788054324708; https://orcid.org/0000-0001-5914-2124As raias da família Rhinopteridae Bonaparte, 1835 são altamente migratórias e estão distribuídas em águas mornas em mares tropicais e temperados. O litoral brasileiro registra a ocorrência de 2 espécies, Rhinoptera bonasus e Rhinoptera brasiliensis, as quais, devido ao grande tamanho corpóreo são alvo fácil de captura acidental como fauna acompanhante de pescarias de arrasto, como as de camarão marinho. As relações filogenéticas do gênero ainda não estão elucidadas, havendo suspeitas sobre a validade de algumas espécies, bem como a possível presença de linhagens crípticas ainda não descritas dentro de algumas espécies. O presente estudo tem por objetivos, através da utilização do gene COI elucidar a posição filogenética das espécies de Rhinoptera que ocorrem no litoral brasileiro, em relação às outras linhagens válidas do gênero, bem como a verificação da possível presença de linhagens crípticas dentro do gênero. Indivíduos das duas espécies foram coletados ao longo da costa brasileira. Sequências adicionais de outras espécies do gênero foram baixadas no Genbank e adicionadas ao banco de dados. Os resultados demonstram a presença de R. brasiliensis na Costa Norte brasileira, ampliando sua área de ocorrência no litoral brasileiro. Adicionalmente, 2 linhagens de R. bonasus foram recuperadas demonstrando que a espécie é formada por um complexo de espécies. O gênero Rhinoptera deve passar por revisões sistemáticas mais apuradas para correta elucidação de quantas espécies compõem o gênero no litoral brasileiro.