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    Trabalho de Curso - Graduação - MonografiaAcesso aberto (Open Access)
    DNA Barcoding revela diversidade molecular na espécie Eleotris melanosoma Bleeker, 1853 (Eleotridae: gobiiformes)
    (2026-07-16) GORDO, Vinícius Cunha; COSTA, Aurycéia Jaquelyne Guimarães da; http://lattes.cnpq.br/5342395629825218; SOUZA, Marcelo Nazareno Vallinoto de; http://lattes.cnpq.br/9327173329561099
    A família Eleotridae compreende peixes anfídromos conhecidos como "sleepers", cuja identificação taxonômica é historicamente complexa devido ao extremo conservadorismo morfológico e à ocorrência de espécies crípticas. O objetivo deste estudo foi diagnosticar o status taxonômico de diferentes populações de Eleotris melanosoma por meio de DNA Barcoding e da delimitação automatizada de espécies. Sequências do gene mitocondrial Citocromo C Oxidase Subunidade I (COI), totalizando um alinhamento de 573 pares de bases (pb) e abrangendo 14 espécies do gênero Eleotris, foram obtidas de bancos de dados públicos e analisadas por meio do método de agrupamento de Neighbor-Joining (K2P) e do algoritmo Automatic Barcode Gap Discovery (ABGD). A análise de distribuição de distâncias genéticas revelou um padrão bimodal marcante, evidenciando um hiato de código de barras (barcode gap) bem definido que estabeleceu um consenso estável de 20 Unidades Taxonômicas Operacionais Moleculares (MOTUs) para o gênero. A topologia filogenética demonstrou que E. melanosoma não compõe um clado homogêneo, dividindo-se em três linhagens geneticamente divergentes e geograficamente estruturadas: a Linhagem 1, correspondente a espécimes da Indonésia e Palau (divergência intraespecífica de 0,43%); a Linhagem 2, que abrange indivíduos da Polinésia Francesa e Ilhas Salomão, apresentando a maior divergência interna (1,3%); e a Linhagem 3, vinculada ao complexo Eleotris diamsoi na região de Madagascar, Mayotte e África do Sul (0,15%). A divergência genética interespecífica par a par (distância p) dentro do complexo atingiu 5,4% entre as Linhagens 1 e 2, e até 7,3% em relação à Linhagem 3, confirmando a existência de espécies crípticas sob o morfotipo clássico de E. melanosoma. Adicionalmente, as análises recuperaram clusters estruturados para Eleotris fusca e mantiveram as sequências de Eleotris perniger agregadas em uma única MOTU, embora sob uma divergência intraespecífica relativamente alta de 1,3%, sugerindo um processo de diferenciação geográfica incipiente ou fluxo gênico residual. Os resultados confirmam a robustez do gene COI combinado ao algoritmo ABGD como ferramentas moleculares fundamentais para refinar hipóteses evolutivas e guiar uma abordagem taxonômica integrativa na família Eleotridae.
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    Trabalho de Curso - Graduação - MonografiaAcesso aberto (Open Access)
    Heterogeneidade molecular em Atelopus hoogmoedi (Anura: Bufonidae) no leste da Amazônia, Pará - Brasil
    (2018-12-04) SILVA, Gabriela Wemilly Barros da; OLIVEIRA, Elciomar Araújo de; http://lattes.cnpq.br/1088366040232425; HERNÁNDEZ-RUZ, Emil José; http://lattes.cnpq.br/9304799439158425; https://orcid.org/0000-0002-3593-3260
    O gênero Atelopus é um dos mais diversos da família Bufonidae e devido à cor brilhante são referidas como rãs harlequin. Por ocorrerem em áreas de florestas maduras 97% das espécies estão em risco de extinção. Uma das espécies, Atelopus hoogmoedi, ocorre no norte e sul do rio Amazonas e que provavelmente representa mais de uma unidade evolutiva. Baseado nessa premissa, nosso objetivo foi comparar os indivíduos de A. hoogmoedi do sul e norte do rio Amazonas. O DNA foi extraído pelo método fenol clorofórmio de oito indivíduos de A. hoogmoedi, sendo sete de Monte Alegre (norte do rio Amazonas) e um de Anapu (sul do rio Amazonas) e em seguida foi amplificado via Reação em Cadeia da Polimerase (PCR) utilizando o marcador mitocondrial 16S rRNA. Na análise filogenética de Máxima Verossimilhança para a espécie A. hoogmoedi revelou um grupo parafilético com três linhagens: Guiana Francesa 1 e 2; Guiana e Monte Alegre; e Anapu. A distância genética entre Anapu e Monte Alegre foi de 2.9%. De acordo com o Automatic Barcode Gap Discovery (ABGD) em ambos os modelos Simple Distance e Kimura 2 Parameters, A. hoogmoedi coletada em Anapu foi reconhecido como uma espécie distinta daquelas do Escudo das Guianas. Dessa forma Atelopus hoogmoedi ao sul do rio Amazonas foi classificada como espécie candidata não confirmada, necessitando de mais coletas e acesso aos indivíduos das outras localidades de sua ocorrência.
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    Trabalho de Curso - Graduação - MonografiaAcesso aberto (Open Access)
    Subestimação de espécies de Dendropsophus (Anura, Hylidae) do Baixo Rio Tocantins, Leste do Pará, Brasil
    (2023-12-19) COSTA, José Otávio Wonghon; HERNÁNDEZ-RUZ, Emil José; http://lattes.cnpq.br/9304799439158425; https://orcid.org/0000-0002-3593-3260
    O conhecimento da biodiversidade é fundamental para melhor tomada de decisões e ao mesmo tempo se esforça para promover a conservação das espécies. Assim, estudos que visam compreender a diversidade das espécies são essenciais para a biologia da conservação. Dendropsophus é o gênero mais diverso dentro da família Hylidae, com diversos estudos apontando incertezas taxonômicas envolvendo o gênero. Com base num fragmento da subunidade I da citocromo oxidase mitocondrial (COI) e análises de delimitação de espécies (GMYC, ABGD), revelamos uma diversidade subestimada de espécies na região do baixo rio Tocantins, no estado do Pará, Brasil. As espécies candidatas ainda podem ser diferenciadas morfologicamente dos demais congêneres. Será novas amostragens e o uso de outros marcadores moleculares como o 16S rRNA, além de dados de vocalização, para validar o status de novas espécies
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