Navegando por Assunto "DNA barcoding"
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Trabalho de Curso - Graduação - Monografia Acesso aberto (Open Access) O uso do DNA Barcoding para análise de substituição do peixe Brachyplatystoma filamentosum, PIMELODIDAE (Filhote) comercializadas In Natura no município de Breves, Ilha do Marajó.(2017-11-10) GONÇALVES, Andressa Santos; SALES, João Bráullio de Luna; http://lattes.cnpq.br/1304788054324708; https://orcid.org/0000-0001-5914-2124O Brasil é o país com maior potencial hídrico do planeta, apresentando cerca de 13,7% da água doce do mundo. A economia da região amazônica, especialmente das comunidades ribeirinhas, depende em grande parte dos recursos do rio, o controle da pesca nessa região acaba sendo escasso. O código de barras de DNA (DNA barcoding) mostra-se como um aliado nessa tarefa, pois é uma técnica que utiliza sequências curtas de DNA, como diagnóstico molecular para a identificação ao nível de espécies e faz com que estas informações sejam obtidas de forma rápida e barata. Este estudo pretende avaliar com o uso do DNA barcoding a possível substituição de peixes comercializados in natura sob o nome popular de filhote (Brachyplatystoma filamentosum) e por quais espécies estão sendo substituídos, apontando suas possíveis causas. Foram coletadas 12 amostras de B. filamentosum, provenientes da feira municipal de peixe de Breves, Ilha do Marajó e 12 amostras provenientes da cidade de Mocajuba, região do Rio Tocantins, totalizando 24 amostras. O DNA genômico total foi extraído com o Kit de extração DNA Wizard Genomics (Promega Inc), os DNA foram migrados em eletroforese submarina em gel de agarose low melt de 1% para quantificação da qualidade dos mesmos. A partir da extração, foram realizadas as amplificações, através da Reação em Cadeia da Polimerase (PCR) do gene Citocromo Oxidase subunidade I – COI. Os resultados obtidos apontaram uma baixa taxa de substituição do peixe B. filamentosum, não indicando caráter de substituição intencional, mas faz-se necessário um monitoramento do pescado na região amazônica e a implementação de Leis para o pescado, mas em especial ao filhote, para ele não seja sobre explorado.Trabalho de Curso - Graduação - Monografia Acesso aberto (Open Access) Uso do código de barras de DNA para verificar a autenticidade da rotulagem de filés in natura de dourada (brachyplatystoma rousseauxi, castelnau, 1855) comercializados em supermercado e na feira municipal de Breves - PA(2018-01-25) GALIZA, Rayrisson Luis da Conceição; SALES, João Bráullio de Luna; http://lattes.cnpq.br/1304788054324708; https://orcid.org/0000-0001-5914-2124Brachyplatystoma rousseauxii, é uma espécie da família Pimelodidae, popularmente conhecida como dourada, onde a mesma apresenta uma elevada importância comercial para região amazônica brasileira. Recentemente, com a abertura da exploração comercial desta espécie, e principalmente a modernização das formas de comercialização, como a filetagem, tem gerado duvidas junto aos consumidores sobre possíveis substituições de espécies de elevado valor comercial, por outras de menor valor, o que acarreta fraude comercial. O presente estudo, através da ferramenta de DNA de código de barras, investigou amostras de peixe comercializadas como “dourada” no município de Breves (feira livre e supermercado) bem como amostras provenientes de outros municípios para inferir se B. rousseauxii é alvo de substituições comerciais. 54 amostras foram utilizadas no presente estudo, tendo uma porção do gene citocromo oxidase subunidade I (COI) amplificado para cada espécime. Os resultados apontam que a ferramenta de DNA foi efetiva em identificar 100% dos indivíduos utilizados no presente estudo, indicando que apenas duas amostras não correspondiam geneticamente a B. rousseauxii, mas sim a B. capapretum que possui a mesma distribuição de B. rousseauxii embora, com características morfológica bem distintas. Todos os indivíduos coletados em supermercado e identificados como “dourada” foram geneticamente idênticos a B. rousseauxii. Os resultados aqui obtidos reforçam a necessidade da implementação de metodologias de identificação de pescado adicionais, as quais possam garantir aos consumidores a validade das espécies que os mesmos desejam consumir.Trabalho de Curso - Graduação - Monografia Acesso aberto (Open Access) Utilização da ferramenta de DNA Barcoding para identificação genética de arraias da família Potamotrygonidae garman, 1877 do município de Portel Pará(2016-04-28) VANZELER, Jesiane Teixeira; SALES, João Bráullio de Luna; http://lattes.cnpq.br/1304788054324708; https://orcid.org/0000-0001-5914-2124As raias de água doce pertencem à família Potamotrygonidae, pertencem a um grupo monofilético de elasmobrânquios restritos as bacias de rios em regiões neotropicais compostos por um grupo de peixes muito diversificados na América do Sul e se encontram na maioria dos rios tropicais do continente. Estão presentes em todos os países da América do Sul, menos no Chile. Atualmente, as informações acerca das raias de água doce neotropicais apresentam-se ainda de forma incompleta, bem como dados taxonômicos, distribuição atualizada das espécies que compõe o grupo bem como sua atual relação filogenética, principalmente de regiões como a Ilha do Marajó e sua porção Ocidental. O grupo das raias marinhas também apresenta uma série de complicações taxonômicas, onde padrões de coloração de disco e forma, em muitos casos não são informativos a nível de espécie. Apesar do Brasil possuir um número significativo de taxonomistas, ainda existem grupos de espécies pouco estudadas, as quais podem apresentar espécies que não foram descritas e que precisam de identificação, o qual requer tempo, recursos e pessoas capacitadas para tal atividade. Por isso, a ampliação de estudos integrados com dados moleculares que possam facilitar o processo de identificação de espécies e resolver os problemas taxonômicos vem se intensificando ao longo do tempo. O DNA barcoding é um método rápido, eficiente e acessível globalmente para delimitar e identificar novas espécies. O benefício da técnica de DNA barcoding abrange não somente estudos taxonômicos, mas também filogenéticos e de genética de populações. Através dos resultados obtidos, é possível perceber que existem a presença de pelo menos três espécies de potamotrigonideos na região da cidade de Portel, Ilha do Marajó: Potamotrygon motoro, P. orbignyi e Paratrygon aireba. Entretanto, quando comparadas as sequencias do presente estudo com as disponíveis no genbank, percebe-se que P. motoro não é uma espécie monofilética, onde recentemente foi redescrita e limitada apenas a bacia do Rio Paraná-Paraguai. Desta forma a espécie presente na região de Portel provavelmente é uma espécie nova e ainda não descrita. Os resultados gerados são os primeiros a indicarem uma caracterização molecular da fauna de Potamotrigonideos da região de Portel, indicando que novos estudos tanto morfológicos quanto genéticos são necessários para aumentar o conhecimento sobre aa espécies da família Potamotrygonidae da região.Trabalho de Curso - Graduação - Monografia Acesso aberto (Open Access) Utilização da ferramenta de DNA Barcoding sugere espécie críptica dentro da raia criticamente ameaçada Aetobatus narinari Euphrasen, 1790 no atlântico sul ocidental(2016-02-19) OLIVEIRA, Cintia Negrão de; SALES, João Bráullio de Luna; http://lattes.cnpq.br/1304788054324708; https://orcid.org/0000-0001-5914-2124Os elasmobrânquios (peixes cartilaginosos) estão inseridos no grupo dos vertebrados viventes mais antigos que existem, com registro fóssil datado entre 350-400 milhões de anos atrás, inserido dentro da classe Chondrichthyes, a qual se divide em duas subclasses: Elasmobranchii (Tubarões e Arraias) e Holocephalii (Quimeras). Apresentam atualmente cerca de 1.100 espécies. O gênero Aetobatus é composto por pelo menos quatro espécies nominais das quais A. narinari é a mais importante dentro do gênero devido ao fato de possuir distribuição global. Estudos realizados nos últimos anos tem confirmado a presença de espécies crípticas dentro de A. narinari, entretanto, a fauna do Atlântico Sul Ocidental ainda não foi alvo de investigações morfológicas ou moleculares. O presente estudo pretende testar a eficiência da ferramenta de DNA barcoding na identificação de A. narinari vendida e processada em mercados de Bragança-PA e Valença-BA, identificadas como arraia pintada. Os resultados indicam que as amostras provenientes de Bragança e Valença, são geneticamente idênticas a indivíduos provenientes da Florida, Belize e Cayman, havendo ainda a formação de vários subgrupos ao longo das sequencias utilizadas no presente estudo. Adicionalmente, os resultados também indicam que sequências provenientes de indivíduos do estado de São Paulo, são geneticamente muito distantes de todas as outras sequências utilizadas no presente estudo, indicando a presença de possíveis espécies crípticas dentro de A. narinari no Atlântico Sul Ocidental. Novos estudos moleculares e morfológicos são necessários para tentar elucidar quantas espécies realmente existem dentro de A. narinari, bem como se existem ainda subpopulação ao longo de sua área de ocorrência na região do Atlântico Sul Ocidental.