Navegando por Assunto "Aligned sequences"
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Trabalho de Curso - Graduação - Artigo Acesso aberto (Open Access) FASTA2STRUCTURE: uma ferramenta de fácil utilização para converter multiplos alinhamentos Fasta para o formato do STRUCTURE(2023-12-15) GUIMARÃES , Daphne Kemilly Santos; BRITO, Carla Denise Bessa de; http://lattes.cnpq.br/3118860174342134; https://orcid.org/0000-0002-8469-0138; SILVA, Adam Rick Bessa da; http://lattes.cnpq.br/6415904655659166; https://orcid.org/0000-0002-6093-6180O software STRUCTURE tem ganhado popularidade como ferramenta para estrutura populacional e análise genética. No entanto, formatar dados para atender aos requisitos específicos do STRUCTURE pode ser extremamente complicado e suscetível a erros, especialmente ao lidar com dados multilocus. Este artigo destaca a criação de um aplicativo de interface gráfica do usuário (GUI) adaptado para agilizar o processo de conversão de vários alinhamentos de sequência em um único arquivo coeso que é compatível com o STRUCTURE. O aplicativo foi desenvolvido utilizando Tkinter para GUI e Biopython para manipulação de arquivos FASTA. Este programa processa os arquivos, identifica sites variáveis e converte as sequências em um formato binário. Posteriormente, as sequências são concatenadas e apresentadas dentro da área de texto da interface gráfica, permitindo que os usuários revisem e confirmem os resultados. Além disso, o programa armazena os resultados concatenados em um arquivo, entregando uma entrada pronta para uso para o software STRUCTURE. Esta aplicação oferece uma solução eficiente e confiável para transformar vários arquivos FASTA alinhados em um arquivo de formato binário concatenado, que é compatível com o software STRUCTURE. Com sua interface gráfica amigável e abordagem de redução de erros, esta ferramenta se mostra inestimável para pesquisadores que desenvolvem pesquisas no campo de estrutura populacional e análise genética.