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Trabalho de Curso - Graduação - Monografia Acesso aberto (Open Access) Implementação do algoritmo PSO em CUDA utilizando técnicas da capacidade de computabilidade 6.1 para otimização de problemas de engenharia com restrições(2018-12-12) ALVARES, PauloVictor de Lima Sfair; MONTEIRO, Dionne Cavalcante; http://lattes.cnpq.br/4423219093583221O presente trabalho trata da implementação e análise do algoritmo de PSO (Otimização por Enxame de Partículas), algoritmo que abre possibilidade para a paralelização, em CUDA, utilizando um dos recursos da capacidade de computabilidade 6.1, a shared memory permitindo a diminuição da latência de comunicação entre o core CUDA e a memória. Com este trabalho, objetivou-se implementar o algoritmo de PSO de forma que o resultado obtido após a execução deste, fosse mais preciso, obtendo-se mais casas decimais de precisão no resultado, permitindo que aplicações que necessitem de uma precisão maior possam ser executadas com este algoritmo, além de melhorar o tempo de execução, utilizando a nova arquitetura das placas de vídeo NVidia GTX série 10, Pascal. Para a análise e comparação de resultados, foram utilizados resultados do trabalho produzido por Daniel Souza em 2014, e nos resultados obtidos, foi alcançada uma melhora, tanto na precisão, onde foi aumentado de 6 casas decimais confiáveis para 16 casas decimais confiáveis, quanto no tempo de execução do algoritmo, o que abre a possibilidade para que aplicações que necessitam de precisão extrema, como aplicações médicas e da biomedicina, possam ser executadas sem que o tempo de execução seja afetado.Trabalho de Curso - Graduação - Monografia Acesso aberto (Open Access) RadarUFPA: proposta de aplicação para identificação de problemas de infraestrutura da Universidade Federal do Pará(2017-10-10) SOUZA AFONSO, Leonardo Augusto; MONTEIRO, Dionne Cavalcante; http://lattes.cnpq.br/4423219093583221Esse trabalho propõe uma solução de software para as barreiras de comunicação entre a comunidade acadêmica e o órgão responsável pela manutenção da infraestrutura da Universidade Federal do Pará. Direcionado pelos conceitos de redes sociais, redes colaborativas, nas informações coletadas dos estudantes, servidores e visitantes da Universidade Federal do Pará, além de análise empírica a partir da vivência do autor neste ambiente, foi possível gerar uma base de dados que auxiliou no projeto e desenvolvimento da aplicação proposta. O trabalho também apresenta o projeto RadarUFPA de forma detalhada em nível de arquitetura e modelagem das aplicações, web e móvel, e a utilização destas por parte de seus usuários.Trabalho de Curso - Graduação - Monografia Acesso aberto (Open Access) Sarcasm - uma ferramenta semiautomática para reconstrução e análise de matrizes estequiométricas(2018-02-22) SOUZA, Ronald Assunção; FRANCÊS, Regiane Silva Kawasaki; http://lattes.cnpq.br/1572121571522063A Biologia de sistemas é a análise do comportamento e interação entre os componentes de um sistema biológico, sendo uma área que vem crescendo bastante e que permite diversos tipos de análises, como a modelagem de processos biológicos e simulações. A análise do balanço de fluxo (FBA) é um método matemático utilizado para analisar o fluxo de metabólitos de uma rede metabólica, permitindo prever a taxa de crescimento de um organismo ou a taxa de produção de um metabólito de interesse. Para o cálculo do FBA, faz-se necessário e essencial o uso de matriz estequiométrica, estrutura que indica os diversos componentes que participam de uma reação (reagentes e produtos) e suas proporções moleculares relativas. Esta matriz acaba sendo difícil de ser construída manualmente, pois demanda tempo pelo fato de que uma via metabólica possui muitas reações e componentes. Em nosso estudo desenvolvemos o sARCASM (semi-Automatic Recontruction and Analysis of Stoichometric Matrix), um conjunto de scripts escrito em Python cujo objetivo é automatizar, padronizar e diminuir o tempo do cálculo comparado a outros pipelines que utilizam o FBA. O sARCASM ajuda na reconstrução in silico de vias metabólicas de interesse e utiliza as informações de anotação de um genoma alvo para que por meio do banco de dados do KEGG, sejam obtidos os grupos de genes ortólogos, assim como o modelo estequiométrico, geração do modelo no formato SBML e aplicação do método FBA. Foi utilizado como testes a via metabólica da biossíntese de ácidos graxos e o organismo estudado foi a Exiguobacterium antarcticum B7 e os resultados obtidos foram bastante aproximados quando comparados com um trabalho de referência.